影片背景设置在11世纪的波斯，一位英国人为了学习医术掩盖其天主教徒的身体，加入了伊斯巴罕一所只招收犹太人的医学院。他治随的老师名叫阿维森纳，是历史上著名的犹太科学家、思想家和医生。阿维森纳的著作达200多种，最著名的有《哲学、科学大全》，在当时是高水平的百科全书；另一部巨著是《医典》，直到17世纪西方国家还视为医学经典，至今仍有参考价值。《神医》结合史诗与虚构，展现了在那个被愚昧和迷信统治的世纪里一群人探索真知的无畏精神。

CIA顶尖探员罗根（艾伦·艾克哈特AaronEckhart饰）在前妻过世之后，想要修补与女儿艾美（丽亚娜·莱伯拉托LianaLiberato饰）的关系，于是辞去了中情局顶尖探员的职务，带着和他关系疏远的艾美，搬到了安特卫普开始尝试过一般人的生活。随后，罗根进入比利时一家资金亿万美元的跨国公司的安全系统部门，担任安全顾问一职。某次，在整个团队的共同努力下，他们成功破解一个高度机密的安全装置。但第二天清晨，当罗根神采奕奕地到达办公地点时，却发现与公司相关的所有人事物通通凭空消失，而且所有证明公司存在过的证据也全被销毁。与此同时，罗根发现他的助理竟然是一名训练有素的特工，负责的任务就是杀死自己和自己的女儿。更让罗根感到意外的是，他在CIA的前同事兼女友也奉命将其追捕归案。为了活命并找出幕后凶手，罗根和女儿艾米在被一群训练有素的杀手团队追杀的同时，开始了一段逃亡之旅。在这个过程当中，父女之间开始慢慢相互了解，并重新建立起信任和亲情......然而威胁和阻碍不断升级，并逐渐将父女二人卷入一场更大的、国际性的阴谋当中....

　　这个故事讲述了一个安静地生活在海底的外星人，直到他们的生态系统被污染破坏后，他们被迫毁灭人类。科学家们争先恐后地避免了一场世界末日。这本书在德国和其他欧洲国家是一个巨大的畅销书。当阿尔-戈尔（Al Gore）的《难以忽视的真相》（An Inconvenient Truth）试图激起人们对环境的关注时，《蜂群》成为越来越多基于人类对地球的滥用将得到回报这一理念的电影中的最新一部。