夜幕笼罩下的东京霓虹闪烁，在城市某个不起眼的角落，充满温情的深夜食堂悄然开张。妖媚的川岛玉子（高冈早纪饰）一脸颓唐，她的靠山不久前去世，却没给她留下分文遗产。在颓唐无助的时候，貌不惊人的上班族小初（柄本时生饰）走入玉子的视野，他们的关系迅速拉近。乡下女孩栗山美知留（多部未华子饰）独自来到东京，走投无路之际她在老板（小林薰饰）这里吃了霸王餐，事后主动登门要求打工还钱，女孩因此找到了暂时的栖身地。3•11大地震让福岛灾民大石谦三（筒井道隆饰）和来自东京的志愿者杉田明美（菊池亚希子饰）相识。大石对后者展开狂热的追求，甚至尾随来至东京。平凡人的小故事，在深夜食堂内交替上演……

小小的深夜食堂，迎来送往这个喧嚣都市内奔波疲惫的人们。他们漫无目的，或者迷失方向，却往往不经意间在这个蕞尔角落找到前行的希望。每当在工作中遇到烦心事，赤冢范子（河井青叶饰）便穿着丧服在大街上游荡。偶然机缘，她在葬礼上结识了一名男子（佐藤浩市饰），干涸的心田便为爱情所滋润。经营荞麦面生意的高木圣子（木村绿饰）与儿子清太（池松壮亮饰）相依为命，清太和年龄长于自己的木村纱织（小岛圣饰）相恋，而一直与圣子好姐妹相称的圣子却全不知情。年逾古稀的老太太夕起子（渡边美佐子饰）被诈骗电话骗到了东京，食堂的热心人们担心她的钱被人骗走，老奶奶则不以为意。这趟前来，她仿佛有个未了的心愿。本片根据同名漫画改编，为同名深夜剧的第二部电影版。