城市在恢复平静后，大反派重新召集旧部卷土重来，并勾结外星恶势力朗格试图称霸地球，忍者神龟莱昂纳多（皮特·普劳泽克PetePloszek饰）、拉斐尔（阿兰·里奇森AlanRitchson饰）、多纳泰罗（杰瑞米·霍华德JeremyHoward饰）和米开朗基罗（诺尔·费舍NoelFisher饰）与女记者艾蓓丽尔·奥尼尔（梅根·福克斯MeganFox饰）、韦恩·芬威克（威尔·阿奈特WillArnett饰），及面具义警凯西·琼斯（斯蒂芬·阿梅尔StephenAmell饰）并肩作战打击恶徒。在史莱德（布莱恩·泰BrianTee饰）逃脱拘留后，他与疯狂的科学家巴克斯特斯·托克曼（泰勒·派瑞TylerPerry饰）及其两个笨拙的左膀右臂猪面和牛头联合，发布了一个控制世界的恶魔计划。在神龟们与史莱德及其同伙对抗的同时，他们发现自己正面临着一个更邪恶的力量大反派格朗，神龟们面对的将是宇宙级的强大对手。

芬利是一位有才华、有抱负的小提琴家，她在去爱尔兰一个沿海小村庄参加大学学期的海外项目的路上遇到了著名的年轻电影明星贝克特。令人心动的贝克特带领紧张的芬利进行了一次冒险性的重新觉醒，她鼓励芬利掌控自己的未来，直到他的明星地位的压力挡在了路上，一段意外的浪漫就出现了。