讲述了在一个原本百无聊赖的平凡夏天，一群企鹅凭空出现在远离大海的小镇之上。在目睹了牙医大姐姐所投掷的可乐罐变成企鹅之后，有着强烈好奇心的小少年青山同学决心一探究竟，并展开了一场不可思议而令人难忘的夏季冒险。本片改编自日本著名作家森见登美彦同名小说作品。

在家长重重压力下想要离家出走的大雄（大原惠美配音）、胖虎（木村昴配音）、小夫（关智一配音）和静香（嘉数由美配音），在哆啦A梦（水田山葵配音）的协助下来到了七万年前的地球。在创造属于自己的世外桃源时，他们偶遇神秘少年古古儿，继而被卷入了光明族和黑暗族的部落争斗之中。大家齐心协力智斗巨尊比，不想却发现了一个惊天秘密……