张英雄（王锵饰）从小就生活在父母的溺爱之中，性格难免有些软弱。某日，张英雄的父亲张肃清（姚培德饰）在和政府拆迁办的工作人员陆志强（许江宁饰）的争吵中突发心梗去世了。无奈之下，母亲带着张英雄搬进了舅舅家中，过起了寄人篱下的生活，舅舅和舅妈对待他们的态度并不算客气，这让张英雄的心理更加不平衡了，他决定找陆志强报仇。张英雄搬出了舅舅家，在一家小店里当起了服务生，从这家店看出去刚好能够看到陆志强的家，张英雄就此认识了陆志强的女儿陆珊珊（周冬雨饰）。陆珊珊是一个有着轻微智障的女孩，她的单纯和善良慢慢的消解了张英雄内心里的仇恨，他发现自己竟然爱上了她。

1999年始的数年内，一向安宁平静的弘州市先后发生多起针对年轻女性的强奸命案，受害者的皮肤均遭凶手割下奇异的血雏菊形状。负责侦破这场惊天连环凶杀案件的重任，则交到了警察刘一波，和搭档何晨的肩上。而这场斗智斗勇的追凶之旅，一追就是十九年……

反恐特战队队长钟原在执行任务中，击毙猛犸组织二号人物引来复仇。在解救妻子赵欣的行动中钟原被注射病毒倍受折磨。DK生物公司董事长江寒邀请初恋情人、生化专业高材生的赵欣及其父亲参加公司“有益菌”研究。反恐指挥中心根据T国请求选派“专家”潜入公司。痛失爱子的赵欣主动请缨“退出现役”、深入虎穴。接二连三的恐怖事件，使“新纪元计划”逐渐浮出水面。被病痛折磨的钟原率领乔大鹏、麦萌萌等特战队员绝地出击，在爱妻赵欣和五年前“失踪”的战友陆豪的配合下，成功粉碎了恐怖组织连环阴谋和生化袭击，揭开了江寒以“有益菌”为载体制造病毒的真实面目。