高中生四月一日君寻（福山润配音）有着令他十分困扰的灵异体质，他总是能在不知不觉的情况下吸引大量的灵体。一日，偶然中他踏进了一间魔法商店，遇见了美丽神秘的店主壹原郁子（大原沙耶香配音）。郁子告诉他这是一件帮人达成愿望的商店，四月一日君寻遂许下了希望能解除特异体质的愿望，可是这愿望售价昂贵，四月一日君寻不得不在店里打工来付清欠款。此间，他结实了沉默寡言的白目鬼静（中井和哉配音）、厄运缠身的九轩葵（伊藤静配音），以及一只造型怪异的名叫魔可拿的宠物。在打工的过程中，四月一日君寻接触了一系列与愿望有关的事件，他发现，这个世上有好的愿望，有坏的愿望，有单纯的愿望，却也有无论如何努力都无法达成的愿望。人性、命运、必然、偶然，这一切都在店主壹原郁子的掌控之中。

在每一个角落都被探索完毕的世界中，唯一残留的秘境——大洞穴“阿比斯”。不知道延续到何方，深不见底的巨大纵向洞穴，栖息着奇妙奇怪的生物们，沉眠着现在的人类无法制造的贵重遗物。“阿比斯”那充满了不可思议的姿态吸引了人们，并驱使人们展开冒险。如此，多次挑战大洞穴的冒险者们，陆续得到了“探窟家”的名号。住在建造于阿比斯边缘的城镇“奥斯”的孤儿莉可，梦想着有朝一日成为母亲那样伟大的探窟家，并解开阿比斯的谜团。某天，以母亲莱萨的白笛被发现为契机，莉可决定潜入阿比斯深处。被莉可捡到的丧失记忆的机器人雷格，也为了寻找自己的记忆而决定同行。莉可在深界四层中了穿弹兽的毒。救了莉可的，是“生骸”娜娜奇。娜娜奇也成为两人的同伴，三人的冒险向着波多尔多所在的深界五层进发。在那里，他们遇到了一位自称为普鲁修卡的女孩子……

刚刚结束了与叛忍集团“晓”的抗争，木叶村被一股诡异不祥的气氛所笼罩。此时此刻，漩涡鸣人（竹内顺子配音）沉浸在对家人的思念中，孤独无助。某个晚上，心情糟糕的鸣人巧遇刚刚和家人吵架的小樱（中村千绘配音），二人在公园闲聊之际，神秘的斑（内田直哉配音）突然出现，并向二人使出瞳术。眩晕过后，鸣人和小樱发现看似一如平常的木叶村，曾经熟悉的伙伴竟然性格发生巨变。一连串不正常的事件令二人苦恼不已。更令人难以置信的是，包括佐助以及鸣人的父母波风水门（森川智之配音）和玖辛奈（篠原惠美配音）也出现在他们的面前。斑的阴谋慢慢展开……本片根据岸本齐史的漫画原作改编，为该作品第九部动画剧场版。

主角本田吾郎的父亲本田茂治本来是职业棒球选手，自幼丧母，但是六岁时父亲在比赛中被乔吉普森(原译:约翰吉布森)的触身球击中头部而脑血肿而过世。其后吾郎的幼稚园老师星野桃子(茂治的女友)便收养吾郎，九岁时茂野英毅（父亲的同学，同样是职业棒球选手）与星野桃子结婚，本田吾郎姓氏便改为茂野，历经少棒联盟与高中棒球时代，进入美国大联盟挑战的成长历程。励志 亲情 友情的故事！

阿尔扎诺帝国帝国魔术学院的兼职讲师格伦·勒达斯是假自习之名行打瞌睡之实的惯犯。就算难得站上了讲台，他也是专搞直接把课本钉在黑板上之类的花招，耍废的程度连学生也不以为然。被这样的格伦惹恼的学生──有着“师见愁”之名的希丝缇娜·菲伊贝鲁向他提出了决斗。结果令人遗憾地，格伦以悬殊的差距吞下了败战……然而学校发生了前所未有的恐怖事件，学生也无一幸免地受到了波及。“不许伤害我的学生！”如此说的格伦于此时发挥了真正的本领！

成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。

短篇「伊尔泽的笔记」中的伊尔泽·兰纳是第34次调查兵团出征成员，所在小组全灭。在走投无路之后，同样遭遇了巨人，但是却没有被马上吃掉，发现了惊人都现象巨人说出了有意义的言语。记录下之后，尝试着与巨人交流，未果。被巨人吞噬。但是，这个片段相当的关键。其用来记录的笔记本被利威尔兵长拾获。

幸平创真（松冈祯丞配音）出生于料理世家，其父经营着一间家庭餐馆，小小年纪的幸平即将父亲当做了榜样，发誓成为父亲那样的料理家。某一日，父亲找到了幸平，希望他能够进入顶级的料理学校“远月学园”深造磨练，背负着父亲的期许，幸平踏上了旅程。在学校里，幸平结识了名为薙切绘里奈（种田梨沙配音）的少女，这位传说中拥有“神之舌”的傲娇少女，竟然将幸平所作的料理判定为“不合格”。外表热情开朗内心极有城府的一色慧（樱井孝宏配音）、拥有孱弱身体和强大头脑的丸井善二（小林裕介配音）、活泼开朗的吉野悠姬（内田真礼配音），与这些“同行”交流着，竞争着，幸平还有很长的路要走。

或许过去，又或许未来，人类大规模向宇宙殖民。当人口膨胀到五千亿的时候，散落在宇宙各个角落的人类返回故土地球，却引发了伤亡惨重的归乡战争。为了保护地球这片圣地，人类制定了盖亚制裁，约定不许任何人染指这里。可是曾经作为联合舰队舰长的哈洛克（小栗旬配音）却背叛盖亚制裁，驾驶着他的阿尔卡迪亚号高举叛旗，成为逃逸一百年之久的通缉犯。联合舰队长官伊索拉（森川智之配音）指使自己的弟弟亚马（三浦春马配音）混入阿尔卡迪亚号，探寻尼伯龙根人发明的永动机的秘密。在此期间，哈洛克率领船员向地球挺近，而联合舰队则在太阳系布下天罗地网阻挡他的步伐。遥远的故土，失落已久的真相，令所有人为之震惊……本片根据松本零士的经典科幻漫画改编。