总有一天不论如何都要一起制作动画——上山高中动画同好会的5人向葫芦屋的甜甜圈如此起誓。她们毕业以后，分别在各自的岗位从事动画制作，并通过《第三飞行少女队》而接近了自己的梦想。4年后——。在动画的世界找到了自己的容身之所、逐渐成长起来的5人，开始面对新的苦恼和试炼。

虽然涅吉（佐藤利奈配音）只有10岁，但他强大的魔法能力使得他足以担负起任教麻帆良学院的重任，只是，性格有些害羞又未经人事的涅吉，要他面对班上31名年长且清纯可爱的女生，这样真的没问题吗？每一个魔法使的身边，都会存在一个保护大的勇士，两人之间要签订契约，生死与共。而一直没有勇士相伴的涅吉，居然在阴差阳错之下，和自己的学生，巨力系少女神乐坂明日菜（神田朱未配音）签订了契约。除此之外，情报通朝仓和美（笹川亚矢奈配音），文学少女绫濑夕映（桑谷夏子配音），阴阳师近卫木乃香（近卫木乃香配音），这些女孩子们的出现，也为涅吉惊险刺激的生活增添了一份欢乐。

所谓的“白箱”，是指在动画放送之前，专门制作赠送给参与了动画制作的工作人员们的录像带，其本身拥有着令人感动的悠久历史，因为这些录像带通常都被装在白色的盒子里，所以被成为“白箱”。一直坚守着自己理想的制作人宫森葵（木村珠莉配音）、个性认真但有些懦弱的原画师安原绘麻（佳村遥配音）、怀才不遇的声优坂木静香（千菅春香配音）、CG画师藤堂美沙（高野麻美配音）和容易沉迷与自身兴趣爱好的剧本作家今井绿（大和田仁美配音），五个个性迥异的女孩，朝着顺利完成白箱的梦想共同努力迈进，在这条并不轻松的道路上，会发生哪些有趣的故事呢？