拥有着强大力量的创世神杖被四大神之一的埃及神拉（李璐配音）盗走。为了令宇宙免于被毁灭的悲惨命运，希腊神宙斯（藤新配音）派出了自己的女儿雅典娜（山新配音）追踪神杖的下落。小金刚（皇贞季配音）是自幼生长在孤儿院里的平凡少年，常年凭借着机灵的脑瓜靠着坑蒙拐骗赚钱度日，只为了有朝一日身患重病的青梅竹马小青（C小调配音）能够康复。一次偶然中，小金刚得到了藏有创世神杖下落的藏宝图，随后遭到了雷神托尔（李姝洁饰）的伏击，在争抢之中，藏宝图被破坏，就这样，小金刚成为了唯一一个知道创世神杖在哪里的凡人。就这样，小金刚、雅典娜、托尔，再加上一个来自东方的脱线河神（郝祥海饰），一行四人踏上了寻找创世神杖的旅途。

剧版《十万个冷笑话》第二季第6集中，没有名字的男主角（阿杰配音）在打败鸟不拉屎大王之后，因自身的吐槽能量大爆发而导致地球遭受了空前绝后的大灾难，电影版的故事便从此开始。在灵魂中转站中，男主角意外去到了神秘的“时之狭间”，在神秘人物的帮助下改写了地球被毁的历史，并回到过去成为了拯救地球的英雄；但是意料之外的事情发生了，时空发生混乱，不同维度的二次元人物穿越到了男主的世界，男主更是邂逅了神话中的李靖（宝木中阳配音）和哪吒（山新配音），童话中的白雪公主（朱雀橙配音）和匹诺曹（皇贞季配音），为了扭转错乱的时空，众人一起踏上了再次拯救地球的旅程……

《十万个冷笑话第三季》将延续前两季的故事，继续发展下去。现在已知可能将出版《太2真人篇》太2真人将在第三季的故事中完美回归！