中医世家艾真堂堂主夫妇双双遇难，留下女儿秦芝艾继续行医救人，意外救治了不死傀孟宗竹。孟宗竹身怀秘密来到医馆调查云诗夫妇死因，利用不死傀身份控制小医仙成为她的主人。从此二人一起行走江湖悬壶济世，还卷入了一系列朝堂纷争。最终云诗夫妇死因真相大白，秦芝艾也凭借高超的医术成功救治了皇帝，成为御赐“小医仙儿”。

该剧讲述了少年乐无异因机缘离家踏上偃术修行之旅，旅程中邂逅了百草谷天罡战士闻人羽、太华山弟子夏夷则、身世神秘的少女阿阮等伙伴而展开一段传奇的故事。